As Algas têm um importantíssimo papel na biosfera, pois foram elas as primeiras produtoras de oxigénio no nosso planeta. No presente, elas são as responsáveis pela maior parte da produção nos ecossistemas aquáticos: como produtores primários, formando  a base da cadeia alimentar desses ecossistemas.
As macroalgas marinhas, ou seja, as que têm dimensões maiores que as do fitoplâncton, como as algas verdes, vermelhas e castanhas, fornecem refúgio e alimento a certas espécies de animais marinhos. 
Por vezes, as algas planctónicas multiplicam-se demasiado, normalmente em condições de temperatura óptima e de nutrientes abundantes – formando o que se chama "flor-da-água".
Este fenômeno pode ser uma indicação de poluição e pode levar à destruição da biodiversidade duma massa de água (lago, estuário), uma vez que as algas que morrem são decompostas, levando à diminuição do oxigénio na água.
Mas pode também ser um fenómeno natural, desaparecendo quando a temperatura muda e quando os nutrientes são esgotados pelas algas.